תוכנית הגרעינים הוקמה לזכרו של אודי יהודה אלגרבלי, חייל שנהרג בלבנון בשנת 1994.
מטרתה של התוכנית היא להפגיש בין מגזרים דרך תרומה לקהילה, כדי לצמצם את הפערים והשסעים בחברה, שמלובים במערכות חינוך נפרדות, ולהפגיש בין בני נוער ממגזרים שונים למען עשייה חברתית משותפת.
השאיפה של התוכנית כיום היא להפוך להיות ארגון נוער ברמה הארצית כדי ליצור חברה אחת מאוחדת וסובלנית שמסוגלת לפעול גם כשהחלקים המרכיבים אותה שונים זה מזה.